KOD FX
实验例38: 用KOD FX对曲霉菌Aspergillus oryzae基因破坏的确认





实验例22
  用KOD FX对曲霉菌Aspergillus oryzae基因破坏的确认 











※本实验例发表在第61次 日本生物工学会大会(2009)上。

                           





【背景】



进行曲霉菌基因破坏时进行确认,过去要进行DNA的抽提,非常麻烦,而本实验使用KOD FX,以只在溶液中加热过的曲霉菌的分生孢子为样品进行扩增,判定基因类型。




【样品】曲霉菌基因破坏候选菌株的分生孢子 



【样品的处理】  ①取微量孢子在Buffer*50 μl)中悬浊
                                        *Buffer:100 mM Tris-HCl (pH 9.5), 1 M KCl, 10 mM EDTA



                                  ②95℃10分钟 →Vortex →上清1 μl / 50 μl PCR反应液





【基因名】推定酸性推定酸性羧肽酶carboxypeptidase(ACP)基因





【目的片段】3.6~5.2 kb





 Fig. 1 引物的位置与扩增产物的大小






【反应液组成】取如说明书中记载





 灭菌水

10 <μl>

 2x PCR Buffer for KOD FX

25

 2mM dNTPs

 10 final 0.4mM

 10 pmol/μl Primer  F

 1.5

 10 pmol/μl Primer  R 

 1.5

 KOD FX (1U/μl) 

 1

 前处理样品溶液

 1

Total

 50 μl





PCR循环】



94℃, 2min.
 
[ 98℃, 10sec    68℃, 5min ] (35cycles)




【结果】



可明确地判定基因破坏菌株。




【评语】



过去,对曲霉菌、丝状菌等进行菌落PCR很困难,要判定基因破坏菌株时,需要抽提纯化基因组DNA,而使用KOD FX则无需该操作,可简便地对多重样品的克隆的基因类型进行判别。




【数据提供】



白鹤酒造株式会社 研究开发室
山下 伸雄 老师